一種基于結(jié)構(gòu)從大黃芐叉丙酮合成酶機制。

Hiroyuki Morita，Yoshihiko下川，michikazu tanio，王志加藤，博野，shigetoshi sugio，Toshiyuki Kohno，ikuro安倍

發(fā)表于20080733

摘要

芐叉丙酮合成酶（BAS），植物特有的III型聚酮合成酶（PKS），催化一步脫羧縮合丙二酸單酰輔酶A和4-香豆酰-CoA產(chǎn)生diketide芐叉丙酮。我們解決了兩個野生型和查爾酮生產(chǎn)大黃BAS i207l / l208f突變在1.8分辨率的晶體結(jié)構(gòu)。此外，我們解決了野生型酶的晶體結(jié)構(gòu)，其中一個monoketide香豆酸中間體共價催化半胱氨酸殘基，在1.6分辨率。這是第一個直接證據(jù)，Ⅲ型PKS利用半胱氨酸作為親核試劑和作為聚酮中間體的附著位點。晶體結(jié)構(gòu)顯示，BAS利用一個替代，新的活躍站點口袋鎖定香豆酸的芳香基團，取代查爾酮合成酶的香豆?；Y(jié)合口袋，這是迷失在野生型酶的活性位點和恢復的突變體i207l / l208f。此外，晶體結(jié)構(gòu)表明，一個水分子的親核的Cys-His的天冬酰胺催化三聯(lián)形成氫鍵網(wǎng)絡的存在。這表明，BAS采用酶結(jié)合的diketide中間和最終的脫羧反應產(chǎn)生的硫酯鍵裂解芐叉丙酮催化機械。這些結(jié)果為III型PKS酶的功能多樣性的結(jié)構(gòu)提供了依據(jù)。